期刊简介

               《检验检疫学刊》是由国家质量监督检验检疫总局主管,中国检验检疫科学研究院和中国检验检疫学会联合主办,《食品指南》杂志社编辑、出版,国内外公开发行的国家级科技期刊。现被中国核心期刊(遴选)数据库、中国科技论文与引文数据库(CSTPCD)、中国学术期刊网络出版总库、中文科技期刊数据库等著名检索机构全文收录,适合检验检疫技术人员、业务管理人员、质量监督技术人员、大专院校相关专业及企业有关科技人员阅读。                

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检验检疫学刊杂志2007年第01期

点带石斑鱼神经坏死病毒基因组分析

龚艳清;彭智发;陈信忠;朱昌福;徐淑菲

关键词:点带石斑鱼, 神经坏死病毒, 基因组分析
摘要:[目的]准确诊断发生在福建南部点带石斑鱼育苗场的鱼病.[方法]根据基因库中已报告的石斑鱼NNV核苷酸序列,设计了8对特异性引物,用于扩增点带石斑鱼NNV的RNA1和RNA2特定片段.PCR扩增产物经琼脂糖电泳确认后进行核酸测序,用相应软件进行拼接,得到点带石斑鱼NNV基因组全序列.用DNAstar软件对该序列进行分析,得到相应的氨基酸序列.[结果]该病毒的RNA1含有一个编码依赖RNA的RNA聚合酶(RNA-dependant RNA polymerase,RdRp)的开放阅读框(ORF)为2949nt,编码1个由982个氨基酸组成的蛋白质;RNA2的ORF为1017nt,编码1个由338个氨基酸组成的病毒主衣壳蛋白.将这些核苷酸序列以及推导的氨基酸序列与基因库中同属于罗达病毒科(Nodaviridae)的其他罗达病毒进行同源性比较,该病毒与其他已知的石斑鱼NNV的同源性高.系统发育进化分析也表明,点带石斑鱼NNV与其他石斑鱼NNV亲缘关系很近,同属于赤点石斑NNV血清群,与其他β罗达病毒有一定的距离,与α罗达病毒则有明显的不同.[结论]福建南部个别点带石斑鱼育苗场的石斑鱼感染了神经坏死病毒.